Амплитест sars cov 2 voc v 3 инструкция

Набор «АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», (арт. K-V017-FRT) предназначен для качественного выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетических вариантов особого эпидемиологического значения (VOC) Omicron и Delta путем выявления характерных для данных вариантов мутаций в S гене коронавируса в образцах РНК, экстрагированной из биологического материала человека, в которых обнаружена РНК SARS-CoV-2 методом анализа нуклеиновых кислот.

Инструкция пользователя ↓  
РУ ↓  

Набор «АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», (арт. K-V019-FRT) предназначен для качественного выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетических вариантов особого эпидемиологического значения (VOC) Omicron с дифференциацией линии BA.2 и Delta путем выявления характерных для данных вариантов мутаций в S гене коронавируса в образцах РНК, экстрагированной из биологического материала человека, в которых обнаружена РНК SARS-CoV-2 методом анализа нуклеиновых кислот.

Биологическим материалом для исследования являются:

  • мазок со слизистой носоглотки
  • мазок со слизистой ротоглотки

Принцип работы тест-системы

Сбор биоматериала.png Cбор биоматериала.
Выделение и очистка.png Выделение и очистка вирусной РНК.
Синтез кДНК.png Синтез молекулы ДНК на молекулах РНК коронавируса.
ПЦР.png Амплификация участков кДНК коронавируса.
RT ПЦР.png Флуоресцентная детекция результатов амплификации с помощью мишень-специфичных флуоресцентно-меченых праймеров.

*Реагенты для выделения вирусной РНК не входят в состав набора. Наборы для экстракции рекомендованные производителем:

Набор «АмплиТест РИБО-преп» для выделения РНК/ДНК из биологического материала

Набор «МагноПрайм ФАСТ-Р» для выделения РНК вируса SARS-CoV-2 из биологического материала

«АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», серия CV017

  • ОТ-ПЦР-смесь-FL 3-A
  • ОТ-ПЦР-смесь-FL 3-B
  • ОТ-ПЦР-буфер-R
  • Taq полимераза
  • Ревертаза (MMlv)
  • K-
  • ОКО
  • ПКО Delta
  • ПКО Omicron

6f33eab52492e2b0de58d954555d6819.jpg

AmpliTest SARS-CoV-2

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx, sputum, human feces) by PCR with real-time hybridization-fluorescence detection .  The reagent kit is designed for 96 determinations.

Characteristics

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.4

v4.jpg

Designed for qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic variants of special epidemiological significance (VOC) Omicron (with differentiation of the BA.2 line) and Delta by identifying mutations characteristic of these variants in the S gene of coronavirus in RNA samples extracted from human biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx), in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid amplification .

Characteristics

4.png
6f33eab52492e2b0de58d954555d6819.jpg

AmpliTest SARS-CoV-2

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx, sputum, human feces) by PCR with real-time hybridization-fluorescence detection .  The reagent kit is designed for 96 determinations.

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.3

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic variants of special epidemiological significance (VOC) Omicron and Delta by identifying mutations characteristic of these variants in the coronavirus S gene in RNA samples extracted from human biological material (smears from the nasal and oropharynx) in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid analysis.

Characteristics

v3.jpg
3.png

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.2

v2.jpg

Designed for qualitative detection of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic lines of special epidemiological significance (VOC) Alpha, Delta and Beta / Gamma by identifying mutations characteristic of these lines in the S gene of coronavirus in RNA samples extracted from human biological material (mucosal swabs) nasopharynx and oropharynx) in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid analysis

Characteristics

2.png

AmpliTest Magno-Sorb-Turbo

The kit of reagents is an auxiliary tool in clinical laboratory diagnostics and is used at the preanalytical stage of analysis for the extraction of total RNA/DNA from human biological material (a swab from the nasopharyngeal and oropharyngeal mucosa) for the purpose of subsequent analysis by nucleic acid amplification. Designed to extract  RNA/DNA from 100 samples, including controls.

магно.jpg
рибо.jpg

AmpliTest RIBO-prep

Designed for extraction (isolation) of total RNA/DNA from biological material (nasal and oropharyngeal mucosal swabs, sputum, feces) in order to study the obtained samples by nucleic acid amplification.
«AmpliTest RIBO-prep» version 50 is designed for the isolation of RNA / DNA from 50 samples, including controls. 
«AmpliTest RIBO-prep» version 100 is designed for RNA isolation from 100 samples, including controls.

AmpliTest SARS-Cov-2 LAMP

Designed for the qualitative determination of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) coronavirus SARS-CoV-2 RNA in biological material (smears from the nasopharyngeal and oropharyngeal mucosa) by isothermal loop amplification (LAMP) with real-time fluorescence detection._cc781905 -5cde-3194-bb3b-136bad5cf58d_ The reagent kit has a capacity of 96 determinations.

lamp1.png

Characteristics

lamp.png

AmpliTest SARS-CoV-2 auto

 Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (nasal and oropharyngeal mucosal swabs) by PCR with hybridization-fluorescence detection in the » real time». Can be used in conjunction with automated nucleic acid extraction stations or manually using a magnetic stand.  The reagent kit is designed for 96 determinations.

Characteristics

авто.jpg
авто.png

1.1 Экспресс-тест SARS-CoV-2-Антиген предназначен для быстрого качественного определения нуклеокапсидного антигена вируса SARS-CoV-2 методом иммунохроматографического анализа в назофарингеальных мазках, взятых у лиц с подозрением на COVID-19 во время острой фазы заболевания.
1.2  COVID-19 — это острое респираторное инфекционное заболевание с высоким фактором риска среди большинства людей. В настоящее время основным источником инфекции являются пациенты, инфицированные новым коронавирусом (SARS-CoV-2); бессимптомно инфицированные люди также могут быть источником инфекции. По данным текущего эпидемиологического исследования, инкубационный период составляет от 1 до 14 дней, в основном от 3 до 7 дней. Коронавирусы — это обширное семейство вирусов, вызывающих заболевания, варьирующиеся от простуды до более тяжелых заболеваний, таких как ближневосточный респираторный синдром (MERSCoV) и тяжелый острый респираторный синдром (SARS-CoV). Новый коронавирус (nCoV) — это новый штамм, который ранее не выявлялся у людей и был впервые обнаружен в 2019 году. Клиническими проявлениями являются системные симптомы, такие как лихорадка и усталость, сопровождающиеся сухим кашлем, одышкой и т.д., которые могут быстро развиваться в тяжелую пневмонию, расстройство дыхания и острую дыхательную недостаточность. Дистресс-синдром, септический шок, полиорганная недостаточность, тяжелые нарушения кислотно-щелочного обмена и другие симптомы еще более опасны для жизни.
1.3  Экспресс-тест для определения антигена коронавируса нового типа обнаруживает нуклеокапсидный антиген нового коронавируса в образце мазка, взятого из носоглотки человека. Тест может быть выполнен в течение 10 минут без использования лабораторного оборудования.
1.4  Наличие быстрого диагностического теста в месте оказания медицинской помощи имеет решающее значение в диагностике пациентов и предотвращении дальнейшего распространения вируса. Он предоставляет возможность получения предварительных данных в диагностике инфицирования новым коронавирусом.
Любая интерпретация или использование этого предварительного теста должна также основываться на других клинических данных, а также на профессиональном суждении медицинских работников. Следует принять к рассмотрению и альтернативные методы для подтверждения результатов, полученных с помощью этого теста.
1.5  Положительные результаты указывают на наличие вирусных антигенов, но для определения статуса инфекции необходимо сопоставление с другими клиническими данными пациента и другой диагностической информацией. Положительные результаты не исключают бактериальную инфекцию или коинфицирование другими вирусами.
1.6  Отрицательные результаты следует рассматривать как предварительные, они не исключают заражение вирусом SARS-CoV-2 и не должны использоваться в качестве единственной основы для принятия решений о лечении или наблюдения за пациентом, включая решения о контроле за инфекцией. Отрицательные результаты следует рассматривать в контексте недавних контактов пациента с источником заражения, истории болезни и наличия клинических признаков и симптомов, соответствующих COVID-19, и, если необходимо, подтверждать молекулярным анализом, для наблюдения за пациентом.
1.7  Экспресс-тест для обнаружения антигена предназначен для использования медицинским персоналом, специально проинструктированным и обученным методам диагностики in vitro и надлежащим процедурам инфекционного контроля, а также для индивидуального использования для самоконтроля состояния при острой респираторной инфекции.

2.1 Высокая скорость и простота использования иммунохроматографического анализа обеспечивается благодаря предварительному нанесению аналитических реагентов на мембрану тестовой кассеты. Контакт с пробой запускает иммунохимические реакции, приводящие к окрашиванию определенных участков мембранной полоски, по которому можно через 10 мин визуально регистрировать результат анализа.
2.2 Экспресс-тест предназначен для обнаружения присутствия или отсутствия нуклеокапсидного белка вируса SARS-CoV-2 в образцах мазков, взятых из носоглотки пациентов, подозреваемых на COVID-19, при наличии соответствующих признаков и симптомов. Когда образцы обрабатываются и добавляются в тестовое устройство, антигены вируса SARS-CoV-2, присутствующие в образце, связываются с антителами, меченными коллоидным золотом на тест-полоске. Комплексы антиген-антитело перемещаются по тест- полоске в зону реакции и захватываются линией антител, связанных на мембране.
2.3  Результат считается положительным, когда комплексы антиген-антитело, осажденные в позиции теста «Т», и контрольная позиция «С» на тестовом устройстве образуют цветные линии.
Результат считается отрицательным, когда цветная линия образуется только в позиции контроля «C», но не появляется видимая цветная линия в позиции теста «T».
2.4  Для контроля качества, чтобы гарантировать достоверность результата теста, цветная линия всегда должна появляться в позиции контроля «C», независимо от того, появляется ли результат (положительный или отрицательный) в позиции теста «T». Если в контрольной позиции «C» нет видимой линии, результат экспресс-теста считается недействительным, и необходимо провести новый тест.

Экспресс-тест SARS-CoV-2-Антиген может изготавливаться в следующих комплектациях:
а) комплектация 1 содержит:
— тестовая кассета, готова к использованию, упакована в пакет из фольги, 20 шт. Каждый пакет содержит 1 тест-кассету и 1 осушитель;
— тампон для взятия образцов, готов к использованию, в индивидуальной упаковке из бумаги с прозрачным верхом, 20 шт;
— экстракционная пробирка, готова к использованию, 20 шт;
— насадка для экстракционной пробирки, готова к использованию, 20 шт;
— буферный раствор для экстракции образцов, готов к использованию, 6 мл, 1 флакон (или 2 флакона по 3 мл);
— инструкция по применению.
б) комплектация 2 содержит:
— тестовая кассета, готова к использованию, упакована в пакет из фольги, 1шт. Каждый пакет содержит 1 тест-кассету и 1 осушитель;
— тампон для взятия образцов, готов к использованию, в индивидуальной упаковке из бумаги с прозрачным верхом, 1 шт;
— экстракционная пробирка, готова к использованию, 1 шт;
— насадка для экстракционной пробирки, готова к использованию, 1 шт;
— буферный раствор для экстракции образцов, готов к использованию, 0,5 мл, 1 пробирка;
— пипетка Пастера, 1 шт;
— инструкция по применению.
Необходимый, но не предоставляемый материал:
— таймер или часы;
— средства индивидуальной защиты, такие как защитные перчатки, медицинская маска, защитные очки и лабораторный халат;
— соответствующий контейнер для биологически опасных отходов и дезинфицирующие средства;
— калиброванная микропипетка на (0,05 — 0,5) мл с наконечниками для дозаторов.

3.1 Использовать экспресс-тест необходимо в строгом соответствии с инструкцией.
3.2 Этот экспресс-тест предназначен только для диагностики in vitro.
3.3 Со всеми образцами следует обращаться как с биомедицинскими отходами, содержащими потенциально инфекционные вещества. Процесс утилизации использованного экспресс-теста и материалов для образцов должен соответствовать местным законам об утилизации инфекционных веществ или лабораторным нормам.
3.4  Надевайте соответствующие средства индивидуальной защиты (например, халат, перчатки, очки, маску) при использовании экспресс-теста. Работы проводить с соблюдением мер предосторожности в соответствии с требованиями.
3.5  Правильный сбор, хранение и транспортировка образцов имеют решающее значение для выполнения этого теста.
3.6  После использования тестовую кассету необходимо утилизировать. Тест нельзя использовать более одного раза.
3.7  Не прикасайтесь к реакционной зоне тестовой кассеты.
3.8  Не используйте экспресс-тест после истечения срока годности.
3.9  Не используйте тестовую кассету, если пакет проколот или если его герметичность нарушена.
3.10  Тестирование должно проводиться специально обученным медицинским персоналом. Образцы также берутся квалифицированным медицинским персоналом.
3.11  Результат теста должен интерпретироваться врачом или обученным медицинским специалистом вместе с клиническими данными и результатами других лабораторных тестов.
3.12  Со всеми образцами и использованными экспресс-тестами следует обращаться как с биомедицинскими отходами, содержащими потенциально инфекционные вещества.
3.13  Результаты должны быть прочитаны сразу же по истечению 10 минут после введения образца в отверстие для образцов тест-кассеты. Результаты теста станут недействительными через 20 минут.
3.14  При взятии мазка из носоглотки используйте тампоны, входящие в комплект. Использование других тампонов может привести к ложноотрицательным результатам.
3.15  Перед использованием проверьте срок годности и целостность упаковки тестовой кассеты. Если упаковка тестовой кассеты повреждена и срок годности истек, его нельзя использовать.
3.16  Необходимо соблюдать время тестирования и считывания результатов.
3.17  После вскрытия пакета с тестовой кассетой, анализ следует провести в течение 60 мин. Тестовую кассету можно использовать только один раз.
3.18   Экспресс-тест должен храниться при температуре (2-30) °С. Беречь от влаги, прямых солнечных лучей, тепла и холода.
3.19   Результаты анализа предназначены для предварительной клинической оценки. Клинический диагноз заболевания следует рассматривать в сочетании с симптомами и признаками заболевания, историей болезни пациента, другими лабораторными тестами и ответом на лечение.

4.1 Настройка теста
Перед использованием экспресс-теста пакет с тестовой кассетой и буферный раствор должны быть доведены до комнатной температуры (18-25) °С.
Извлеките из пакета тестовую кассету непосредственно перед тестированием.
Пометьте тестовую кассету и экстракционную пробирку для каждого исследуемого образца. Поместите промаркированные экстракционные пробирки в штатив.
Снимите крышку с флакона с буфером для экстракции образца, держите флакон вверх дном. Сожмите флакон и добавьте 7 капель (~210 мкл) буферного раствора в пробирку для экстракции. При индивидуальном использовании экспресс-теста отобрать пипеткой Пастера буферный раствор из пробирки и добавить 9 капель (~210 мкл) в пробирку для экстракции.
4.2 Сбор образцов мазков из носа
Чтобы взять мазок из носа, осторожно вставьте тампон для взятия образцов в ноздрю с наибольшей секрецией при визуальном осмотре. Плавным вращением проталкивайте тампон до сопротивления на уровне носовых раковин (около 2,0-2,5 см вглубь ноздри). Прокрутите тампон 5 раз по стенке носа, затем выньте его из ноздри.
4.3 Подготовка образца
После взятия пробы немедленно погрузите тампон в буфер. Чтобы образец, извлеченный из тампона, полностью проник в буфер, 6 раз поверните тампон по стенке пробирки в течение 20 секунд, оставьте тампон в пробирке на 1 минуту, а затем пальцами, удерживая пробирку (стенка пробирки не твердая), несколько раз сожмите тампон, при этом медленно удаляйте его из пробирки. Прижатие тампона к стенке пробирки очень важно, так как при этом образца, содержащего жидкость, остается в пробирке как можно больше. Вынув тампон и выбросив его в контейнер для биологически опасных отходов, плотно наденьте насадку (входит в комплект) на верхнюю часть экстракционной пробирки и осторожно встряхните ее, чтобы качественно перемешать находящуюся внутри жидкость.

5.1 Удерживая экстракционную пробирку вертикально вверх дном. Сожмите ее и через насадку для экстракционной пробирки добавьте 3 капли (около 70-90 мкл) подготовленной ранее жидкости с образцом в центр лунки для образца (S-лунка), убедившись, что в ней нет пузырьков воздуха.

5.2  Запустите таймер. Считайте результат через 10 минут. Не более чем через 20 минут.

6.1 Положительный результат: как в позиции теста «T», так и в контрольной позиции «C» появляются видимые цветные линии. Если тестовая позиция «Т» имеет бледный цвет, результат также считается положительным (рисунок 2).
6.2  Отрицательный результат: цвет отображается только в контрольной позиции «C», а в позиции теста «T» окраски нет.
6.3  Недействительный результат: если контрольная позиция «C» остается без появления цвета, результат теста считается недействительным, поскольку контрольное обнаружение не сработало. В таком случае требуется повторное исследование образца.

6.4  Ограничения исследования
6.4.1  Этот экспресс-тест предназначен для обнаружения наличия или отсутствия антигенов к SARS-CoV-2 в респираторных образцах, взятых у лиц, имеющих контакт с COVID-19, или у лиц при наличии соответствующих признаков и симптомов заболевания в первые 7 дней.
6.4.2  Этот экспресс-тест представляет собой качественный анализ.
6.4.3  Точность анализа зависит от качества взятия пробы. Неправильный сбор образцов, их неправильное хранение повлияют на результат теста.
6.4.4   Результаты этого экспресс-теста предназначены для предварительной клинической оценки. Подтвержденный диагноз может быть установлен только после оценки всех клинических и лабораторных данных.
6.4.5   Из-за ограничений, которые имеет экспресс-тест для обнаружения антигенов, при отрицательных результатах тестирования рекомендуется использовать тест амплификации нуклеиновых кислот или методы идентификации вирусных культур для проверки и подтверждения результатов.
6.4.6   Положительные результаты анализов не исключают коинфицирование другими вирусами. Отрицательный результат этого экспресс-теста может быть вызван:
1)  неправильным сбором образцов, неправильной передачей или использованием образцов;
2)  уровень вируса SARS-CoV-2 ниже предела обнаружения теста;
3)  вариации вирусных генов, которые могли вызвать изменения в детерминантах антигена.

7.1  Чувствительность экспресс-теста SARS-CoV-2-Антиген: 97,8%, в сравнении с тестом на нуклеиновую кислоту, были подтверждены положительные случаи.
7.2  Специфичность набора: 100 %, отрицательные случаи были также подтверждены тестом на нуклеиновую кислоту.
7.3  Воспроизводимость экспресс-теста SARS-CoV-2-Антиген: межсерийная 97%, внутрисерийная 99%.
7.4  Перекрёстная специфичность: перекрестная специфичность с вирусом гриппа A, вирусом гриппа B, аденовирусом, вирусом Коксаки, вирусом ECHO и энтеровирусом отсутствует; отсутствует перекрестная специфичность с Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia psittaci и Chlamydia trachomatis; отсутствует перекрестная специфичность с Acinetobacter baumannii, Bordetella pertussis, Candida albicans, Escherichia coli, Haemophilus influenzae и Neisseria gonorrhoeae.

8.1 Хранить при температуре (2-30) °С в запечатанном пакете до истечения срока годности. Не замораживать.
8.2 Тест-кассету следует использовать в течение 1 часа после ее извлечения из пакета.
8.3 Сразу после использования флакон с буфером для экстракции образца следует закрыть крышкой.
8.4 Экспресс-тест следует использовать до истечения срока годности.
8.5 Срок годности — 18 месяцев с даты изготовления.

УП «ХОП ИБОХ НАН Беларуси» ул. Академика В.Ф.Купревича, д.5, корп.3, 220141, г. Минск, Республика Беларусь
Тел./факс +375-17-272-52-57 E-mail: hopmang.bel@gmail.com http://www.hopiboh.org
По вопросам, касающимся качества набора, обращаться в ОТК, тел. +375-17-396-87-38 
Рекламации на качество экспресс-тестов присылайте предприятию-производителю.
В случае нарушения предусмотренных производителем условий хранения,
транспортировки и процедуры постановки экспресс-теста, рекламации рассматриваются как необоснованные.

Метод определения
ПЦР с детекцией в режиме реального времени.

Исследуемый материал
Мазок со слизистой носоглотки и/или ротоглотки

Для проведения исследования в медицинских офисах необходимо предъявить СНИЛС и документ удостоверяющий личность.

Синонимы: Мазок из носо- и ротоглотки на РНК SARS-CoV-2, включая определение штаммов Омикрон и Дельта.

SARS-CoV-2 RT-PCR, nasopharyngeal/oropharyngeal swab, variants Omicron and Delta.

Краткое описание исследования «ПЦР-тест на РНК коронавируса SARS-CoV-2, включая определение штаммов Омикрон и Дельта, в мазке со слизистой носоглотки и ротоглотки»

SARS-CoV-2 относится к большому семейству РНК-содержащих вирусов – коронавирусов (лат. Coronaviridae), вызывающих респираторные заболевания. В настоящее время известно о циркуляции среди населения четырех видов коронавирусов (HCoV-229E, -OC43, -NL63 и -HKU1), которые круглогодично присутствуют в структуре ОРВИ и, как правило, вызывают поражение верхних дыхательных путей легкой и средней тяжести. К семейству коронавирусов также относятся опасные вирусы SARS-CoV и MERS-CoV, вызывающие тяжелый острый респираторный синдром и ближневосточный респираторный синдром, соответственно. 

Основным источником инфекции SARS-CoV-2 является больной человек, в том числе находящийся в инкубационном периоде заболевания. В настоящее время считается, что инфекция передается воздушно-капельным (при кашле, чихании, разговоре), воздушно-пылевом и контактным путями. При этом факторами передачи могут быть: воздух, пищевые продукты и предметы обихода, контаминированные SARS-CoV-2.

Инкубационный период составляет от 2 до 14 суток. 

Диагноз коронавирусной инфекции SARS-CoV-2 устанавливается на основании клинического обследования, данных эпидемиологического анамнеза и результатов лабораторных исследований.

Для заболевания характерно наличие клинических проявлений острой респираторной вирусной инфекции. Основными симптомами являются повышение температуры, кашель сухой или с небольшим количеством мокроты, одышка, миалгия и утомление, ощущение заложенности в грудной клетке. На раннем этапе заболевания возможны диарея, тошнота, рвота. Различают легкую, среднюю и тяжелую формы инфекции SARS-CoV-2. Тяжелая форма заболевания протекает как пневмония с острой дыхательной недостаточностью, острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС), сепсис.

Патогенез новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2 изучен недостаточно. Данные о длительности и напряженности иммунитета в настоящее время отсутствуют. Иммунитет при инфекциях, вызванных другими представителями семейства коронавирусов, нестойкий и возможно повторное заражение.

Количество вариантов SARS-CoV-2 в настоящее время превышает 1000 разных генетический линий. Большинство зарегистрированных мутаций SARS-CoV-2 не имеют функционального значения. Только отдельные линии имеют выраженное эпидемическое значение. Варианты дельта и омикрон, получившие широкое распространение, несут в своем геноме мутации, повышающие контагиозность вируса. Вариант омикрон, несущий множественные замены в S-белке коронавируса, половина из которых расположены в рецептор-связывающем домене, обладает наивысшей контагиозностью среди всех вариантов SARS-CoV-2.

Для специфической лабораторной диагностики, подтверждающей инфекцию SARS-CoV-2, применяют метод ПЦР.

Набор реагентов для выявления РНК генетических вариантов «Омикрон» и «Дельта» коронавируса SARS-CoV-2 основан на определении характерных мутаций в S гене. Это позволит наладить мониторинг за циркуляцией новых разновидностей вируса «Дельта» и «Омикрон» с целью проведения необходимых противоэпидемических и клинических мероприятий.

Набор «АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», (арт. K-V017-FRT) предназначен для качественного выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетических вариантов особого эпидемиологического значения (VOC) Omicron и Delta путем выявления характерных для данных вариантов мутаций в S гене коронавируса в образцах РНК, экстрагированной из биологического материала человека, в которых обнаружена РНК SARS-CoV-2 методом анализа нуклеиновых кислот.

Инструкция пользователя ↓  
РУ ↓  

Набор «АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», (арт. K-V019-FRT) предназначен для качественного выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 генетических вариантов особого эпидемиологического значения (VOC) Omicron с дифференциацией линии BA.2 и Delta путем выявления характерных для данных вариантов мутаций в S гене коронавируса в образцах РНК, экстрагированной из биологического материала человека, в которых обнаружена РНК SARS-CoV-2 методом анализа нуклеиновых кислот.

Биологическим материалом для исследования являются:

  • мазок со слизистой носоглотки
  • мазок со слизистой ротоглотки

Принцип работы тест-системы

Сбор биоматериала.png Cбор биоматериала.
Выделение и очистка.png Выделение и очистка вирусной РНК.
Синтез кДНК.png Синтез молекулы ДНК на молекулах РНК коронавируса.
ПЦР.png Амплификация участков кДНК коронавируса.
RT ПЦР.png Флуоресцентная детекция результатов амплификации с помощью мишень-специфичных флуоресцентно-меченых праймеров.

*Реагенты для выделения вирусной РНК не входят в состав набора. Наборы для экстракции рекомендованные производителем:

Набор «АмплиТест РИБО-преп» для выделения РНК/ДНК из биологического материала

Набор «МагноПрайм ФАСТ-Р» для выделения РНК вируса SARS-CoV-2 из биологического материала

«АмплиТест SARS-CoV-2 VOC v.3», серия CV017

  • ОТ-ПЦР-смесь-FL 3-A
  • ОТ-ПЦР-смесь-FL 3-B
  • ОТ-ПЦР-буфер-R
  • Taq полимераза
  • Ревертаза (MMlv)
  • K-
  • ОКО
  • ПКО Delta
  • ПКО Omicron

6f33eab52492e2b0de58d954555d6819.jpg

AmpliTest SARS-CoV-2

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx, sputum, human feces) by PCR with real-time hybridization-fluorescence detection .  The reagent kit is designed for 96 determinations.

Characteristics

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.4

v4.jpg

Designed for qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic variants of special epidemiological significance (VOC) Omicron (with differentiation of the BA.2 line) and Delta by identifying mutations characteristic of these variants in the S gene of coronavirus in RNA samples extracted from human biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx), in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid amplification .

Characteristics

4.png

6f33eab52492e2b0de58d954555d6819.jpg

AmpliTest SARS-CoV-2

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (smears from the mucous membrane of the nasopharynx and oropharynx, sputum, human feces) by PCR with real-time hybridization-fluorescence detection .  The reagent kit is designed for 96 determinations.

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.3

Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic variants of special epidemiological significance (VOC) Omicron and Delta by identifying mutations characteristic of these variants in the coronavirus S gene in RNA samples extracted from human biological material (smears from the nasal and oropharynx) in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid analysis.

Characteristics

v3.jpg

3.png

AmpliTest SARS-CoV-2 VOC v.2

v2.jpg

Designed for qualitative detection of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of genetic lines of special epidemiological significance (VOC) Alpha, Delta and Beta / Gamma by identifying mutations characteristic of these lines in the S gene of coronavirus in RNA samples extracted from human biological material (mucosal swabs) nasopharynx and oropharynx) in which SARS-CoV-2 RNA was detected by nucleic acid analysis

Characteristics

2.png

AmpliTest Magno-Sorb-Turbo

The kit of reagents is an auxiliary tool in clinical laboratory diagnostics and is used at the preanalytical stage of analysis for the extraction of total RNA/DNA from human biological material (a swab from the nasopharyngeal and oropharyngeal mucosa) for the purpose of subsequent analysis by nucleic acid amplification. Designed to extract  RNA/DNA from 100 samples, including controls.

магно.jpg

рибо.jpg

AmpliTest RIBO-prep

Designed for extraction (isolation) of total RNA/DNA from biological material (nasal and oropharyngeal mucosal swabs, sputum, feces) in order to study the obtained samples by nucleic acid amplification.
«AmpliTest RIBO-prep» version 50 is designed for the isolation of RNA / DNA from 50 samples, including controls. 
«AmpliTest RIBO-prep» version 100 is designed for RNA isolation from 100 samples, including controls.

AmpliTest SARS-Cov-2 LAMP

Designed for the qualitative determination of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) coronavirus SARS-CoV-2 RNA in biological material (smears from the nasopharyngeal and oropharyngeal mucosa) by isothermal loop amplification (LAMP) with real-time fluorescence detection._cc781905 -5cde-3194-bb3b-136bad5cf58d_ The reagent kit has a capacity of 96 determinations.

lamp1.png

Characteristics

lamp.png

AmpliTest SARS-CoV-2 auto

 Designed for the qualitative determination of SARS-CoV-2 coronavirus RNA of severe acute respiratory syndrome (COVID-19) in biological material (nasal and oropharyngeal mucosal swabs) by PCR with hybridization-fluorescence detection in the » real time». Can be used in conjunction with automated nucleic acid extraction stations or manually using a magnetic stand.  The reagent kit is designed for 96 determinations.

Characteristics

авто.jpg

авто.png

Своевременная и качественная диагностика – один из ключевых факторов в борьбе с COVID-19: диагностика необходима и для оценки общей эпидемиологической ситуации, и в случае принятия решения по каждому конкретному пациенту. По данным сайта стопкоронавирус.рф на 12.05.2020 г. проведено более более 5,8  миллионов тестов на наличие нового коронавируса. Цифра огромная. Однако, насколько достоверны результаты? Появляется все больше историй о типичной картине COVID-19 при отрицательных анализах. Почему так может происходить?

Какие тест-системы сейчас используются, каковы их достоинства и недостатки, и почему некоторые регионы страны переходят на диагностику с помощью компьютерной томографии разберемся в этой статье. Все это важно знать фармацевтическим работникам, чтобы быть в курсе текущих событий и грамотно отвечать на вопросы, которые клиенты неизбежно задают и будут задавать людям в белых халатах.

Сначала поговорим о ПЦР-тестах, которые специфически выявляют РНК вируса в пробах. 

Взятие пробы для ПЦР

Показано, что для выявления нового коронавируса подходят смывы из носоглотки – из ротоглотки вероятность ложноотрицательного анализа немного выше [1]. Один из важнейших аспектов – время взятия материала. Проведенные исследования показывают, что при взятии материала у больного в первый день проявления симптомов COVID-19 положительный диагноз поставят с вероятностью 94 %, а вот к 10-му дню это будет всего лишь 67 %! [2].

Существует четкая закономерность: чем позже от возникновения симптомов взят материал, тем меньше шансов обнаружить в нем вирусную РНК.

Есть и хорошие новости: в течение первой недели от возникновения симптомов носоглоточные смывы имеют порядок от 100 000 до 1 000 000 копий вирусной РНК в 1 мл, что делает их легко обнаруживаемыми даже не самыми чувствительными системами. Исследования также показали, что вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях может быть одинаковой у людей с проявленной симптоматикой и при бессимптомном течении болезни [3].

Транспортировка и хранение проб для ПЦР

Хранить образцы рекомендуется при температуре 2-8°C не больше 72 часов (более длительное хранение требует заморозки на -70°С и ниже) [4]. Соответственно, при нарушении температурного режима вероятность ложноотрицательного результата также повышается. Из-за перегруженности лабораторий, можно предположить, что большая часть образцов не хранится перед анализом надлежащим образом.

Точность разных ПЦР-тест-систем 

После попадания образцов в лабораторию правильность диагноза будет зависеть во многом от тест-системы, которую там используют. На сегодняшний день помимо двух тест-систем, разработанных еще в январе в ГНЦВБ «Вектор», зарегистрировано 8 ПЦР-тест систем [5]:

  •   АмплиТест SARS-CoV-2; разработан ФГБУ «Центр стратегического планирования» (ЦСП) Минздрава РФ, Москва;
  •   АмплиСенс CoVs-Bat-FL (ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва);
  •   Поливир SARS-CoV-2 (ООО «НПФ «Литех», Москва совместно с ФМБА и НИЦЭМ им. Гамалеи);
  •   РеалБест РНК SARS-CoV-2 (АО «Вектор-Бест», Новосибирск, Кольцово);
  •   набор реагентов для выявления РНК коронавирусов SARS-CoV-2 и подобных SARS-CoV (ООО «ДНК-Технология-ТС», Москва);
  •   набор реагентов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 (ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России);
  •   SBT-DX-SARS-CoV-2 (ООО «Система-БиоТех»);
  •   набор ООО «МедипалТех» из Дубны (производителем указано ООО «Амплитек»).

Из них системы «Вектора» и «Вектор-Беста» (последняя через сеть лабораторий «Инвитро» [6]) используются для исследования проб от государственных медицинских организаций. Здесь хочется отметить, что система «Вектора» не содержит в своем составе внутреннего контрольного образца, который должен добавляться во все пробы для контроля правильности выделения РНК и реакции обратной транскрипции [7]. Отсутствие такого контроля может также потенциально приводить к некоторому количеству ложноотрицательных результатов. Хорошая новость заключается в том, что остальные зарегистрированные тест-системы имеют в своем составе внутренний контроль, а также, по-видимому, обладают более высокой чувствительностью, т.е. дают меньше ложноотрицательных результатов.

Что касается частных клиник, то компании «Хеликс» [8] и «Гемотест» [9] заявляют, что они используют систему ГНЦВБ «Вектор», в то время как CMD и «Ситилаб » используют более современные системы ЦНИИ Эпидемиологии и ДНК-технологии, соответственно [10, 11].

Таким образом, в городах, где представлены сетевые лаборатории, есть возможность сдать анализ частным образом и надеяться на точность проведения процедуры. В первые дни появления симптоматики точность будет выше.

Экспресс-системы

Что касается экспресс-тест-систем, то есть опасения, что созданные в сжатые сроки «уникальные» тесты по своему качеству будут уступать системам, основанным на обычной ПЦР. Насколько надежны эти системы покажет время, однако уже сейчас количество ложноотрицательных результатов ПЦР в совокупности с длительностью ожидания результата привело к тому, что в клиниках страны диагноз стали ставить не на основе ПЦР-анализа, а на основе результатов компьютерной томографии (КТ).

КТ

Преимущество КТ-диагностики при наличии клинической картины – это  скорость постановки диагноза и более высокая чувствительность по сравнению с реальностью ПЦР-диагностики: 97,2 % против 83,3 % согласно данным небольшого китайского исследования [12]. Начиная с 4-5 дня заболевания можно различить так называемый симптом «матового стекла», на стадии прогрессирования такие участки  консолидируются,  возникает симптом «булыжной мостовой», «обратного ореола», а в пиковая стадии – «белое легкое» [13]. Возникает закономерный вопрос: отличается ли картина пневмонии, вызванной именно новым коронавирусом, от заболеваний другой вирусной природы. Ответ – нет. Вирусные пневмонии, будь то аденовирус, грипп или другие респираторные вирусы, выглядят на КТ одинаково.

Однако в условиях пандемии, когда подавляющее большинство вирусных пневмоний имеют коронавирусную природу, использование КТ для диагностики становится более чем оправданным. В последней версии методических рекомендаций Минздрава по профилактике, диагностике и лечению COVID-19 указано, что «наличие клинических проявлений в сочетании с характерными изменениями в легких по данным КТ или обзорной рентгенографии органов грудной клетки вне зависимости от результатов однократного лабораторного исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 и эпидемиологического анамнеза» является клинически подтвержденным случаем COVID-19 [14]. Отметим также, что объем поражения легких при РГ и КТ может не иметь прямой корреляции с клинической тяжестью заболевания. 

ИФА (иммуноферментный анализ)

ПЦР-тест-системы, как и КТ-диагностика выявляет COVID-19 в острой фазе. Однако весьма актуальна и информация об уже переболевших, на основании которой можно судить об охвате населения заболеванием, а также о числе бессимптомных случаев. Ответы на эти, а также на многие другие вопросы, может дать тест-система на антитела. На сегодняшний день разработкой таких тест-систем помимо «Вектора» занимаются такие организации как «Вектор-Бест», «НПО «Диагностические системы», ФНКЦ ФХМ ФМБА России, «МБС-Технологии», а также «Генетико» и Институт молекулярной биологии РАН [5]. К сожалению, тест-системы на антитела требуют намного больших усилий и времени на разработку, чем ПЦР-системы, а их чувствительность и специфичность оставляет желать лучшего. Так, проведенное в США исследование доступных система на антитела показало, что лишь 3 из 14 систем дают надежные результаты (т.е. не более 1% ложноположительных результатов), но при этом их чувствительность не превышает 90% относительно положительных контрольных образцов [15]. Какова будет чувствительность и специфичность разрабатываемых российских систем – пока неизвестно.

Итак, самое разумное, что вы можете сказать клиентам:

  1. Если у вас первые пять дней симптомов – вполне можно сдать пробы для ПЦР-диагностики в частных центрах, в идеале, заказав выезд специалистов на дом. Желательно тестироваться в тех лабораториях, которые используют системы с контрольными образцами, о чем мы писали выше. 
  2. Если тест дал отрицательный результат или прошло больше пяти дней от начала болезни, а симптомы сохраняются, то в этом случае можно сделать КТ, при этом соблюдать все меры предосторожности, ведь в очереди запросто могут оказаться люди с новой коронавирусной инфекцией. 
  3. Проводить ИФА при текущей низкой точности – едва ли имеет смысл. 
  4. Если у вас нет симптомов, но был контакт, то можно пройти ПЦР-диагностику, но лучше всего на 14 дней уйти на самоизоляцию и наблюдать за самочувствием.

Регистрируйся на нашем сайте и получай доступ ко всем материалам о COVID-19 в специальном разделе.

Самое важное по теме: антисептик оптики для рукгигиена рукдезинфекция в аптекеправила использования масокмифы и факты о коронавирусефармконсултирование по жаропонижающим и гипотензивным во время пандемии. 

Отвечаем на вопросы в прямых эфирах Вконтакте: https://vk.com/pharmznanie 

Обсудить последние новости со всеми коллегами России вы можете в чатах:

  • Telegram: https://tglink.ru/pharmorden
  • ВКонтакте: https://vk.me/join/AJQ1d_D2XxaDy9IdzL0e6EqH

Понравилась статья? Поделить с друзьями:
  • Боро плюс от прыщей цена инструкция по применению
  • Пылесос самсунг hepa h13 2000w инструкция
  • Нужна ли инструкция по оказанию первой помощи на предприятии
  • Как включить газовый конвектор видео инструкция по применению
  • Саньенг корандо руководство по ремонту